Écologie théorique et appliquée

Coordinatrice : Estelle Pitard

Nous développons depuis quelques années une activité en écologie théorique, qui s’est étoffée récemment de travaux en écologie appliquée. Nous avons en effet pris comme cas d’étude la dynamique spatiotemporelle des herbiers des lagunes littorales, plus précisément la lagune du Bagnas près d’Agde (Menu et al 2021, et thèse d’Adam Bernard 2021-2024 coencadrée avec François Munoz du Liphy à Grenoble).

Notre travail est basé sur l’analyse d’images satellites Sentinel 2 et la classification de l’occupation des herbiers, faite par algorithmes de machine-learning, peut être suivie sur plusieurs années grâce à la fréquence d’acquisition de ces images, au mieux tous les 5 jours. Par ailleurs le suivi des paramètres environnementaux (température, salinité, profondeur, assecs, ..) nous a permis de comprendre les corrélations entre ces paramètres, l’occupation de l’herbier et sa résilience aux changements. Enfin, la distribution spatiale de l’herbier permet de mieux comprendre les processus dynamiques de colonisation et d’extinction en jeu dans ce site. Ceux-ci peuvent être modélisés par des modèles simples de processus de réaction-diffusion stochastiques, qui ont fait l’objet d’un stage de 6 mois en master interdisciplinaire IDIL (travail de Rahim Ayad, article en cours de rédaction avec R. Ayad, J. Dorignac, F. Geniet).

L’étude des processus stochastiques en jeu pourra être poursuivi dans le cadre de modèles théoriques, en particulier dans l’étude de la réponse à un stress, dans le cas de géométries type (par exemple dans le cadre du modèle îles-continent), ou en présence de plusieurs espèces en interactions (collaboration avec Maxime Clenet de l’université de Sherbrooke, François Munoz, Liphy Grenoble).