Écologie théorique et appliquée

Coordinatrice : Estelle Pitard

Nous développons depuis quelques années une activité en écologie théorique, qui s’est étoffée récemment de travaux en écologie appliquée.

Nous avons en effet pris comme cas d’étude la dynamique spatiotemporelle des herbiers des lagunes littorales, plus précisément la lagune du Bagnas près d’Agde (Menu et al 2021, et thèse d’Adam Bernard 2021-2024).

Notre travail est basé sur l’analyse d’images satellites Sentinel 2 et la classification de l’occupation des herbiers, faite par algorithmes de machine-learning, peut être suivie sur plusieurs années grâce à la fréquence d’acquisition de ces images. Par ailleurs le suivi des paramètres environnementaux (température, salinité, profondeur, assecs, ..) nous a permis de comprendre les corrélations entre ces paramètres, l’occupation de l’herbier et sa résilience aux changements.

Enfin, la distribution spatiale de l’herbier permet de mieux comprendre les processus dynamiques de colonisation et d’extinction en jeu dans ce site. Ceux-ci peuvent être modélisés par des modèles simples de processus de réaction-diffusion stochastiques, qui ont fait l’objet d’un stage de 6 mois en master interdisciplinaire.

L’étude des processus stochastiques en jeu est poursuivi dans le cadre de modèles théoriques, en particulier dans l’étude de la réponse à un stress, dans le cas de l’ajout d’une diffusion spatiale, dans le cas de géométries type (par exemple dans le cadre du modèle îles-continent), ou en présence de plusieurs espèces en interactions (collaborations avec l’université de Sherbrooke, le LBBE à Lyon, et le Tata Institute Mumbai en Inde).